此时乃下午4时余，应为真正之战事结束。
据闻当时解放军二十八军副军长萧锋和政治部主任李曼村面对叶飞失声痛哭，叶飞报告华东军区司令员陈毅并报中央军委，请求予以处分。
金门岛上战斗直到10月28日才逐渐平息，零星战斗持续更长。此外，金门岛上逗留时间最久的是解放军第二五三团团长徐博，他在10月26日晚突出重围进入东部山区後，就一直隐蔽在北太武山山洞中，靠挖食地瓜等植物充饥，等待解放军第二次登陆。一位北太武山村民向胡琏抱怨他种的红薯常常在夜晚被部队偷吃，胡琏出动一个师兵力搜山。直到1950年1月，徐博「长发长须，形同野人」，才被发现，後来押到台湾处决。
双方损失
古宁头战役解放军共有三批登陆，首批为10月24日晚的第二十八军第八十二师第二四四团、第二十八军第八十四师第二五一团、第二十九军第八十五师第二五三团和第二十八军八十二师第二四六团第三营，共10个建制营；第二批是10月25日晚的第二十八军第八十二师第二四六团一营二连和两个机Pa0排，以及从全团cH0U调的30多名战斗骨g共300多人、第二十九军第八十七师第二五九团三营的200多名战斗骨g实际上岛100多人；第三批是10月26日晚第二十九军第八十七师第二五九团一营二连的30多名接应伤员撤退，合计9,086人，其中船工、民夫约350人。
解放军战史称登陆部队大都牺牲，包括第二五一团参谋长郝越三、政治处主任王学元、第二四六团副团长刘汉斌，幸存被俘者仅3,900余人，其中营长6人、连长5人、指战员1人，大部被送至台中g城营房关押；其他官阶较高，如第二五一团团长刘天祥是用飞机运回有说是在台绝食Si亡。战史称俘虏解放军7,364人，具T情况是第二○一师俘虏1,495人，第一一八师俘虏3,204人，第十一师俘虏735人，第十八师俘虏995人，第十四师俘虏935人，两者之说法差异甚大。据沈志华在《金门内战与冷战》一书中记载，报导毙伤、俘虏解放军多次变化，版本众多，有1.2万、1.5万、1.7万、2万人不等。胡琏在《金门忆旧》一书中甚至说俘虏船工千人。由此可以看出战场数据统计失实，不过这是的传统。
东南行政长官公署曾经召开新闻发布会声明」伤亡不足3,000人。「战史称阵亡1,267人，伤1,982人，共3,249人。阵亡最高职务的是十九军十四师四十二团团长李光前上校。
据沈志华在《金门内战与冷战》一书认为这个数字的伤亡b例明显小於正常水平。
1953年金门地区阵亡将士公墓收敛古宁头战役、大二担战役、南日岛战役三次战斗的阵亡及病故人员共4,500具屍T，其中大二担、南日岛战斗规模远逊於古宁头战役，可以粗略估算古宁头战役阵亡人数约在3,500人以上结合自己公布的1,267人，加上就地补入金门守军的解放军俘虏2,000人，大致相当，负伤者估计在5,000以上。
据《国民革命军战役史第五部》记载该战役阵亡2,437人，负伤3,700人。虽然伤亡b例依旧偏低，但是阵亡数字b先前翻了一番，伤亡合计达到6,100人以上。
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